Identifier des bactéries grâce à leur carte d’identité génétique

Pour cette technique, on va se servir du fait que chaque espèce bactérienne du microbiote a une identité génétique propre. Grâce à cette identité, on va pouvoir quantifier les bonnes ou les mauvaises espèces bactériennes contenues dans l’échantillon de selle d’un patient. En comparant ces quantités avec des taux de référence (établis à partir de populations saines), on va pouvoir déterminer si un patient a suffisamment ou pas de « bonnes » bactéries et pas trop de « mauvaises » bactéries.

En réalité, on ne va pas s’occuper de toutes les espèces bactériennes, mais seulement de celles qui ont pu être identifiées comme étant impliquées dans des problèmes de santé spécifiques (soit quelques dizaines parmi les centaines qu’abrite le microbiote humain).

Excès ou carence bactérienne ?

Quel est l’intérêt de cette analyse en santé fonctionnelle ? Elle permet pour commencer de mettre en évidence, dans une situation pathologique donnée, la présence d’espèces bactériennes identifiées comme contribuant à ce problème.